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Bon d'examen CHUV: LTM_TR_OO1 Externe: prendre contact avec le laboratoire avant toute demande de typage moléculaire pour préciser les modalités spécifiques. Prélèvements Souches bactériennes. Acheminement Directement au laboratoire. Les envois par poste doivent respecter les consignes de sécurité pour du matériel "biohazard". Méthodes d'analyse La méthode utilisée est l'électrophorèse en champs pulsé (PFGE) de l'ADN digéré. La sélection de l'enzyme de restriction et des conditions d'électrophorèse se fait sur la base de la littérature scientifique et de l'expérience du laboratoire. Délai d'exécution: 1 à 2 mois. Résultats Un typage comparatif est effectué. A chaque souche est assigné un génotype qui sera comparé avec ceux des autres souches analysées. Selon les connaissances scientifiques du moment, une interprétation en terme de génotype identique, apparenté ou différent est effectuée. Acheminement des résultats Un rapport d'analyse est envoyé par courrier au demandeur. Remarques Un contact préalable avec le responsable du laboratoire de typage moléculaire est nécessaire afin de déterminer la disponibilité du laboratoire, les connaissances techniques (pour un germe donné), et le prix de l'analyse. L'application sans discernement d'une méthode de typage en dehors d'un contexte épidémiologique peut amener des informations contradictoire. Les résultats du typage doivent confirmer ou infirmer et non pas remplacer les hypothèses épidémiologiques.
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