Aller au contenu principal
  • Contacts
  • HPCi CHUV
  • HPCi Vaud
  • Laboratoire
  • Accueil
  • Prévention
  • Formation
  • surveillance
  • alertes epidémiologiques2
      • Contacts
      • HPCi CHUV
      • HPCi Vaud
      • Laboratoire

    Vous êtes ici

    Hpci
    Laboratoire
    Typage moléculaire par DLST
    • Le laboratoire
    • Dépistage MRSA
    • Dépistage VRE
    • Recherche d'ESBL et carbapénémase
    • Typage moléculaire par DLST
    • Typage moléculaire par WGS
    • Recherche de légionelles
    • Eaux de dialyse
    • Eau purifiée
    • Eau hautement purifiée
    • Eaux de rinçage des L/D
    • Eaux des échangeurs thermiques
    • Qualité microbienne des fibroscopes
    • Estimation du nombre de micro-organismes sur une surface
    • Recherche de germes totaux sur des instruments
    • Germes totaux dans l'air

    Typage moléculaire par DLST

    Le typage moléculaire a pour but de comparer l'apparentement génétique des souches bactériennes entre elles afin de déterminer si une chaine de transmission (épidémie) est plausible ou non.  Nous avons développé des méthodes de typage basées sur le séquençage de deux régions hypervariables du chromosome bactérien: le Double Locus Sequence Typing (DLST) pour 3 espèces bactériennes d'importance nosocomiale: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa et Clostridium difficile. Pour S. aureus, nous mettons également en évidence le gène mecA (résistance à la meticilline), le type de "Staphylococcal Chromosome Cassette" (SCCmec) et la présence des gènes codants pour la toxine de Panton-Valentin (PVL).

    Bon d'examen

    Prendre contact avec le laboratoire avant toute demande de typage moléculaire pour préciser les modalités spécifiques.

    Prélèvements

    Souches bactériennes de:

    • Staphylococcus aureus, MRSA
    • Pseudomonas aeruginosa
    • Clostridium difficile

    Acheminement

    Directement au laboratoire. Les envois par poste doivent respecter les consignes de sécurité pour du matériel "biohazard" (UN 3373).

    Méthodes d'analyse

    La méthode utilisée a été développée dans notre laboratoire. Elle se base sur le séquençage d'environ 300 à 500 paires de bases de deux gènes hypervariables.

    Résultats

    Le DLST permet de donner un numéro à chaque nouvelle séquence observée pour les deux gènes analysés. Ainsi, la composition des deux séquences (ou allèles) pour une souche donnée définit le génotype ou le "double locus sequence type". Les résultats seront exprimés de la façon suivante: "la souche X appartient au DLST 2-36", ce qui signifie qu'on a trouvé l'allèle 2 du premier gène et l'allèle 36 du deuxième gène.

    Délai d'exécution

    Environ 1-2 mois. Prendre contact avec le laboratoire pour une analyse en urgence.

    Acheminement des résultats

    Un rapport d'analyse est envoyé par courrier/email au demandeur.

    Références

    voir le site www.dlst.org

    Impressum Informations juridiques